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基础疾病指本身出现的需长期治疗的慢性代谢性疾病的统称。

人体各系统出现的慢性急性皆可归纳为基础疾病，如呼吸系统里的慢性支气管炎、支气管哮喘、慢性阻塞性肺疾病；循环系统里的高血压、冠心病等；消化系统里的慢性胃炎、消化性溃疡、病毒性肝炎；泌尿系统里的慢性肾小球肾炎；内分泌系统里的糖尿病、甲亢、甲减等。其余还包括类风湿性关节炎、系统性红斑狼疮、骨关节炎、干燥综合征、痛风等风湿相关疾病均可称为基础疾病。